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Campus de Excelencia Internacional

Máster en Biotecnologia Industrial y Agroalimentaria >>

Asignatura: Bioinformática

Descripción

1.Introducción. Biocomputación, Biología Computacional o Bioinformática. Proyectos Genoma. Genómica funcional. Genómica comparada.2. Programación en bioinformática: scripts (Bash, Perl, PHP)3. Bases de datos de secuencias de ADN y proteínas: EMBL, SwissProt, GenBank. Estructura de los registros (formato) en las distintas bases de datos. Bases de datos integradas: Entrez, PubMed.4. Recuperación de secuencias de las bases de datos. Sequence Retrieval System (SRS) y Entrez (GenBank).5. Rastreo de bases de datos. Búsqueda de homologías. Algoritmos de alineamiento local. FASTA y BLAST.6. Introducción al paquete de software EMBOSS para el análisis de secuencias.7. Edición de secuencias. Formatos FASTA, EMBL y GenBank. Intercambio de formatos.8. Análisis básico de secuencias de ADN y proteínas. Comparación de dos o más secuencias. Matriz de puntos. Algoritmos de alineamiento. Penaliza-ciones. Alineamiento múltiple.9. Genómica funcional. Búsqueda de las pautas abiertas de lectura (ORFs). Propiedades estadísticas de las regiones codificadoras de proteínas. Mé-todos para estimar el potencial codificador de una secuencia. Perfiles o matrices de pesos por posición (PWMs).10. Predicción de genes en procariotas y eucariotas. GeneMark.hmm. GRAIL. GenScan. GenomeScan. GeneID. HMMgene.12. Genómica comparada. Bases de datos de genomas completos: UCSC Genome Browser. Bases de datos para genómica comparada.13. Bases de datos proteómicas. SWISSPROT, TrEMBL y PDB.

Guías docentes

  • Guía docente curso 2019-20: español (24Kb)
  • Guía docente curso 2018-19: español (24Kb)
  • Guía docente curso 2017-18: español (24Kb)
  • Guía docente curso 2016-17: español (38Kb)

Datos del curso académico 2019-20

Módulo: 2. Módulo Optativo

Materia: Bioinformática

Departamento: Biología y Geología

Área: Genética

Grupos del curso académico 2019-20

GRUPOS DOCENTES

  • Grupo: A
  • Turno: Turno de Tarde
  • Profesor/es: Yuste Lisbona, Fernando Juan.
  • Periodo: 
    • Del 27-abr-2020 al 03-may-2020
      Jueves de 17:00 a 21:00 - AULA 21 (2.140) AULARIO IV.
    • Del 04-may-2020 al 10-may-2020
      Lunes de 16:00 a 20:00 - AULA 21 (2.140) AULARIO IV.
      Martes de 16:00 a 20:00 - AULA 21 (2.140) AULARIO IV.
      Miércoles de 16:00 a 20:00 - AULA 21 (2.140) AULARIO IV.
      Jueves de 16:00 a 20:00 - AULA 21 (2.140) AULARIO IV.
      Viernes de 16:00 a 20:00 - AULA 21 (2.140) AULARIO IV.

Datos generales

  • Código:  70982219
  • Carácter: Optativa
  • Curso: 1º
  • Periodo: 2º Cuatrimestre
  • Créditos(ECTS): 3
  • Implantación:
     2016-17

Grupos

Actualizado por: Serv. O. Docente, Planes y Formación

Fecha: 6 de junio de 2020

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